На основе исторического романа Индерка Харгла "Аптекарь Мельхиор и Призрак колодца", второй фильм трилогии о Мельхиоре погружает зрителя в мрачные улицы средневекового Таллина начала XV века. Главный герой, аптекарь Мельхиор Вакенстед, вновь оказывается в центре запутанных преступлений. На этот раз ему предстоит разгадать тайну, связанную с призраком Доротеи — дочери богатого купца, трагически утонувшей в глубинах вод.
Сюжет фильма развивается, когда ночью охранник в высокой башне оказывается убит, а вскоре после этого несколько человек погибают при загадочных обстоятельствах. Мельхиор, стремясь раскрыть эти зловещие происшествия, сталкивается с разнообразными персонажами: от блудницы и священника до иностранного художника и безумного еретика. Каждое новое открытие приводит его в мрачные своды монастыря Пирита, где скрываются опасные тайны, давно преданные забвению.
Однако, помимо расследования, Мельхиор терзается личной трагедией: его возлюбленная Кетерлин неожиданно разрывает помолвку. Этот внутренний конфликт добавляет глубину его персонажу и делает историю еще более захватывающей. Фильм обещает увлекательный детективный сюжет, наполненный историческими реалиями и интригующими поворотами.